Jon er uekte sønn av Herren Eddard Stark av Winterfell, leder av House Stark og Herren Paramount i nord. Nord er en av de deltagende områdene av de syv kongedømmer i Westeros House Stark er en av de store husene i området. Sterk husregler regionen fra deres sete for Winterfell og Eddard innehar også tittelen herre av Winterfell. Han er også vokteren av nord til kong Robert Baratheon.[1]

Eddard gang fortalte King Robert Baratheon at Jons mor er en servering jente kalt Wylla, men nektet å utdype noen nærmere. Jon selv har ingen kjennskap til moren.

Jon ble reist på Winterfell på lik linje med Eddards legitime barn. Han har en eldre halvbror Robb, to yngre hans Sansa og Arya og to yngre halvbrødre Bran og Rickon. Jon tilstedeværelse på Winterfell er en kilde til friksjon mellom Eddard og hans kone, Catelyn, men Catelyn sette til side sin vrede midlertidig når barnet Jon ble alvorlig syk. Jon fikk på godt med sin halvsøsken, spesielt Robb og Arya.